服务器虚拟化不仅仅是硬件整合，经过良好构建的虚拟环境可用于实现日常任务的自动化。尽管完成上述配置需要付出一些努力，但从长远来看自动化往往能够大大减轻管理员的工作量。自动化还保证了日常工作能以与组织需求相一致的方式开展。
最常见的自动化任务是虚拟机创建。诸如VMware vCenter以及微软的系统中心虚拟机管理器都能够基于模板创建虚拟机。管理员能够构建与组织要求相一致的虚拟机模板，然后在今后创建虚拟机时使用这些模板。这保证了虚拟机配置的合理性。
某些hypervisor厂商还考虑到了主机配置自动化，该过程使在裸机上自动安装hypervisor变成了现实。自动化主机配置能够为经常需要上线新服务器的大型组织节省了大量时间。
自动化还经常用于补丁管理。通常虚拟机通过补丁管理系统保持最新状态。例如，Windows虚拟机可能被配置为接收来自Windows服务器更新服务器的补丁更新。然而hypervisor级别的补丁管理需要采用不同的方式处理，因为给hypervisor主机打补丁往往需要重启主机。
自动化能够简化主机级别的补丁管理。例如，微软针对Hyper-V集群部署提供了滚动更新功能。当组织的主机服务器需要打补丁时，补丁管理进程会将虚拟机在线迁移至另一台主机服务器。然后对主机进行打补丁并重启主机，接着将虚拟机通过在线迁移到刚刚完成重启的主机。然后集群中的其他主机会重复完成该过程。尽管可以手动完成该过程，但手动执行相当单调乏味。
针对所有维护任务，Hypervisor级别的自动化并非最佳选择。例如，存储配置好单独执行。ESX以及Hyper-V可以被配置为执行某些与存储相关的任务，但存储厂商提供的自动化系统要比hypervisor厂商提供的功能更强大。
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